Los cambios impulsados por el Gobierno del Estado de Victoria apuntan a incentivar a las niñas a incrementar su participación en los deportes y sentirse más cómodas.
Actualmente en Victoria, la política sobre el uso de uniforme es determinada independientemente por cada escuela.
Pero el ministro de Educación de Victoria, James Merlino dijo que introducirá las reglas a partir del comienzo del próximo año para forzar a cada escuela a que ofrezca opciones para las estudiantes que no quieren usar faldas o vestidos.
Los cambios solo se aplicarán a las escuelas públicas.
"La gran mayoría de las escuelas públicas ofrecen la opción a las estudiantes de usar pantalones largos o cortos, pero hay algunas que no lo hacen", dijo Merlino en declaraciones a la cadena ABC.
Estudios sobre los niveles de actividad física entre las niñas y la relación con los uniformes escolares han demostrado que las niñas practican menos actividades físicas y juegan menos en la escuela cuando usan un vestido o una falda.
Las reglas pondrán al estado de Victoria en línea con Australia Occidental, que anunció cambios a su política a principios de esta semana.
En Nueva Gales del Sur y Queensland, la decisión de ofrecer la opción a las estudiantes sigue siendo exclusivamente de las escuelas.
Merlino dijo que sus dos hijas estaban entre las muchas chicas de Victoria que querían tener la opción.
"Nueve días de cada 10 quieren usar pantalones cortos o largos a la escuela, y creo que debería ser una opción para todas las chicas en todas las escuelas del gobierno", dijo Merlino.
Los colegios católicos o privados no serán afectados por los cambios del gobierno.