印尼军方未有证实原因，声称是技术问题，指两军合作关系时高时低是正常的。
澳洲广播公司(ABC)报导指，原因是一名印尼军官於去年11月在柏斯澳洲空军特种部队(SAS)总部看到的一幅训练海报，指海报内容「冒犯」印尼和印尼立国五原则。
报导又引述知情人士指，内容涉及寻求独立的印尼省份西巴布亚 (West Papua)。
国防部: 尽快恢复与印尼的军事合作
国防部长佩恩 (Marise Payne) 证实，印尼的投诉与军营语言培训设施的「部分教材和评论」有关，并指部分交流暂时中止，但其他领域的军事交通仍然继续。
澳洲国防部表示，会尽快恢复与印尼的军事合作。
澳洲广播公司报导指，澳洲空军总司令宾斯基 (Mark Binskin) 曾致函印尼军方，解释事件中的材料，只是个别事件，并不反映澳洲军方的立场。
报导又引述澳洲军方高层消息指，对印尼的回应感到惊讶。
西巴布亚独立运动
西巴布亚在1545年被西班牙探险家尼果欧提斯(Ynigo Ortiz)发现，现今属印尼管辖，1973年印尼政府将此地更名为伊利安贾亚 (Irian Jaya)，「伊利安」是印尼文的 「新几内亚 」，「贾亚」则指 「荣耀和胜利」。
当地人拒绝这个名字，自称「西巴布亚人」，与东巴布亚人及其他马来人属於同一民族，1999年印尼再次更名为西巴布亚。
西巴布亚独立运动又称自由巴布亚独立运动，自50年代起脱离荷兰殖民後，以游击队丶公民团体丶海外组织等方式，寻求真正的独立与国际认可。
多年来印尼政府对独立运动采取高压政策，并采用移民计划，将一万个伊斯兰教家庭搬迁到西巴布亚，原住民反而变成为少数民族，曾经引发种族冲突，并造成多次大屠杀和大逃难事件，现有约一万名西巴布亚难民居住在东亚汶边界的难民营，联合国难民公署承认其中的3400人为难民。
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