『人权观察组织』（Human Rights Watch）认为，如果澳洲一意孤行，将驻以色列大使馆迁移到耶路撒冷，可能引发印尼公众的示威行动，目标将针对印尼境内的澳洲机构。
莫理逊于 10 月较早时在雪梨 Wenthworth 区补选的前数天，提出可能考虑迁移大使馆方案。 Wentworth 区选民中有 12% 以上为犹太裔人士。
印尼在以巴冲突中是巴勒斯坦的坚定支持者，没有和以色列建交。
『人权监察组织』研究人员哈桑诺（Andreas Harsono） 接受 SBS 访问时表示，如果澳洲决定迁移大使馆，印尼政府将面对压力必须作出回应。
哈桑诺说：「如果印尼政府被视为未有因应当地的抗议作出充分回应，事件可能会升温。我难于预料后果，但可能出现反政府的行动。所以任何印尼政府都会被迫作出回应。 」
此外，前总理谭保提醒总理莫理逊，迁移大使馆将会引起「非常负面的反应」，并会影响澳洲与印尼之自由贸易协定。
谭保在峇里岛与印尼总统佐科威（Joko Widodo）会面后，指出澳洲不应该考虑迁移大使馆，而应该考虑到以穆斯林为主的邻国 － 印尼 － 的反应。
谭保说：「印尼总统佐科威向我表示，正如佐科威早前向总理莫理逊所表示的一样，印尼极度关注澳洲是否会将大使馆从特拉维夫迁移到耶路撒冷。」
澳洲预料在未来数星期内将与印尼签订自由贸易协议。
但总理莫里逊声称，联邦政府的决策是基于澳洲的利益，并非由其他国家支配。
莫里逊说：「政府会经过适当的程序来决定迁移大使馆问题。我必须强调目前还未有决定。」
莫里逊强调：澳洲的外交政策完全由澳洲决定。
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