澳大利亞基督教聯盟（Australian Christian Lobby）一直呼籲人們反對同性婚姻合法化。聯盟主席Lyle Shelton表示，同性婚姻合法化對孩子的教育及反種族歧視法造成連帶影響。在9月16日，澳洲同性婚姻的反對者就舉行了正式的反對集會，基督教聯盟主席Lyle表示"同性戀者在現行法律下已經擁有了平等和自由，如果婚姻的定義被改變，那麼澳洲人民的權利和自由將會被徹底的重新定義"。據澳大利亞人報道稱，Lyle也譴責了Yes陣營的短信攻勢，這些短信甚至被髮送至16歲的青少年的手機上。
據堪培拉時報報道，一所名為Brindabella的基督教學院公開呼籲公眾反對同性婚姻。
澳洲觀察者報道稱，悉尼天主教堂主教Anthony Fisher認為，同性婚姻合法化會對教會的日常運作造成阻礙。
然而，澳大利亞支持同性婚姻的基督徒成立了"澳大利亞基督徒支持婚姻平權聯盟"(Australian Christians for Marriage Equality)，支持Yes陣營，為同性戀者爭取合法婚姻。本台記者夏宇寀訪了"澳大利亞基督徒支持婚姻平權聯盟"的負責人Justin Whealan，及支持同性婚姻的教會牧師Nathan Nettleton。他們表示理解一些基督教會和組織反對婚姻平權的立場，但是也表達了自己對同性婚姻的支持。
